O Laboratório de Micologia de Invertebrados (LMI) desenvolve pesquisas básicas e aplicadas relacionadas às doenças de invertebrados (insetos, ácaros e nematóides) causadas por fungos, sempre voltadas para o avanço do conhecimento sobre as relações patógeno-hospedeiro e para o desenvolvimento de biopesticidas à base de fungos. O laboratório tem disponível um acervo de valor incalculável de linhagens de fungos patógenos de invertebrados para o desenvolvimento de biopesticidas. Além das atividades diretamente ligadas à manutenção e identificação do acervo, a equipe do LMI tem expertise na caracterização de linhagens de fungos quanto à sua atividade biológica contra diversos invertebrados e de outros parâmetros importantes no desenvolvimento de produtos comerciais, como a produção industrial, formulação e manutenção da qualidade do ingrediente ativo. Dessa forma, o LMI tem a estrutura e as condições necessárias de oferecer a empresas do setor novas soluções e tecnologias em biopesticidas, atendendo à demanda crescente do agricultor por ferramentas de controle biológico de pragas.

A Coleção de Fungos de Invertebrados (CFI) criada em 1986 na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia é uma das subcoleção que compõem a Coleção de Agentes de Microrganismos Agentes de Controle Biológico de Pragas da Agricultura mantida na Unidade e uma referência na preservação e caracterização de fungos com uso potencial no controle biológico de insetos. A CFI conta com aproximadamente 1450 linhagens, distribuídas em cerca de 18 gêneros e mais de 60 espécies. Embora a grande maioria das linhagens tenha ação sobre insetos, algumas têm potencial para o controle de outros invertebrados, como ácaros e nematóides. Além de materiais obtidos através de coletas, a CFI preserva linhagens oriundas de intercâmbio com outras coleções do Brasil e do exterior. As culturas são armazenadas na forma liofilizada, sob ultra-congelamento (-80ºC) e criopreservadas em nitrogênio líquido (–196ºC).