O Laboratório de Genômica e Proteônica (LGP) realiza atividades com prospecção e validação de genes e proteínas de interesse agronômico. Vários modelos de interação planta-patógeno vêm sendo estudados no laboratório incluindo café-nematóides, café-Xylella fastidiosa, feijão-de-corda-nematóides, Arachis spp.-nematóides, algodão-nematoides, Xanthomonas campestris pv. campestris-Brassica oleracea e tomateiro-begomovirus. São também prospectados genes e proteínas envolvidos na resposta ao estresse hídrico em arroz. As estratégias utilizadas no laboratório envolvem a busca de genes por análise de genômica funcional, incluindo construção de bibliotecas de cDNA, macroarranjo e qRT-PCR. A expressão diferencial de proteínas é analisada através da eletroforese bidimensional (2-DE), com posterior identificação por espectrometria de massa.