O Laboratório de Fitopatologia (LFT) desenvolve atividades de pesquisa voltadas, principalmente, ao isolamento, identificação, caracterização, conservação e avaliação de fungos para biocontrole de fitopatógenos e plantas daninhas em ensaios de laboratório e campo. Realiza estudos abordando a otimização de cultivo de fungos em meios de cultura e substratos sólidos e dos processos de interação patógeno-hospedeiro. Além disso, mantém a Coleção de Cultura de Fungos para o Controle de Fitopatógenos e Plantas Daninhas.