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Genome-wide patterns of recombination, linkage disequilibrium and nucleotide diversity from pooled resequencing and single nucleotide polymorphism genotyping unlock the evolutionary history of Eucalyptus grandis. Autoria: SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. Autoria: SILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Divergence of DNA methylation and gene expression in Setaria viridis accessions under drought stress. Autoria: SANTIAGO, T. R.; DUARTE, K. E.; SOUZA, W. R. de; STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2018
Investigation of the spread bovine tuberculosis in Southern Brazil by Whole-genome sequencing. Autoria: RODRIGUES, R. de A.; ARAUJO, F. R.; ETGES, R. N.; NUNES, T. P. Mycobacterium bovis is the causal agent of bovine tuberculosis, one of the most important diseases currently facing the cattle industry worldwide. Tracing the source of M. bovis infections that result... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Whole Genome Sequencing of the E. oleifera South-American Wild Oil Palm. Autoria: SOUZA JUNIOR, M. T.; CAPDEVILLE, G. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMILLO, J.; ALVES, A. A.; LEAO, A. P. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. Autoria: VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2018
Quantitative genetics and genomics converge to accelerate forest tree breeding. Autoria: GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, R. T.; CAPPA, E. P.; MÜLLER, B. S. F.; TAN, B.; ISIK, F.; RATCLIFFE, B.; EL-KASSABY, Y. A. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2018
Enumeration, antimicrobial resistance and typing of salmonella enterica: profile of strains carried in the intestinal contents of pigs at slaughter in southern Brazil. Autoria: PAIM, D. S.; PISSETTI, C.; VIEIRA, T. R.; WERLANG, G. O.; COSTA, E. de F.; KICH, J. D.; CARDOSO, M. R. de I. ABSTRACT: Background: Despite a strong association between Salmonella isolation and slaughter hygiene, as measured by the Enterobacteriaceae levels on pre-chill carcass surfaces, a high variation in t... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Towards GWAS and Genomic Prediction in Coffee: Development and Validation of a 26K SNP Chip for Coffea Canephora. Autoria: ANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide SNP genotyping platforms aiming at high-throughput and high-precision genotyping constitute an essential tool to advance breeding by genomic prediction and gene discovery by GWAS. Recent a... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2017

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