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DPIN: um dicionário dos nanoambientes internos das proteínas e seu potencial para transformação em ativos para a agricultura. Autoria: MAZONI, I.; NESHICH, G. Introdução. Nanoambientes proteicos e suas características. Lista dos descritores físico-químicos e estruturais que caracterizam os nanoambientes específicos. Contribuições. Qual é o significado do co... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2020
DIPN: a dictionary of the internal proteins nanoenvironments and their potential for transformation into agricultural assets. Autoria: MAZONI, I.; NESHICH, G. Introduction. Protein nanoenvironments and their characteristics: List of physicochemical and structural descriptors that characterize specific nanoenvironments. Contributions: what does knowledge abo... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2023
Learning to utilize internal protein 3D nanoenvironment descriptors in predicting CRISPR–Cas9 of f-target activity. Autoria: MAK, J. K.; BENDANDI, A.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; STÖRTZ, F.; ROCCHIA, W.; NESHICH, G.; MINARY, P. Despite advances in determining the factors influencing cleavage activity of a CRISPR–Cas9 single guide RNA (sgRNA) at an (off-)target DNA sequence, a comprehensive assessment of pertinent physico-che... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2025
A comparison between internal protein nanoenvironments of ?-helices and beta-sheets. Autoria: MAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; NESHICH, G. In this paper we would first like to address a full characterization of the nanoenvironment found at beta sheet locations and then compare those characteristics with the ones we already published for... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2020
STINGAllo: a web server for high-throughput prediction of allosteric site-forming residues using internal protein nanoenvironment descriptors. Autoria: OMAGE, F. B.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; GONZÁLEZ, J. E. H.; GIACHETTO, P. F.; TASIC, L.; ARNI, R. K.; NESHICH, G. Allosteric regulation is essential for modulating protein function and represents a promising target for therapeutic intervention, yet the complex dynamics of the protein nanoenvironment hinder the re... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2025
Finding protein-protein interaction patterns by contact map matching. Autoria: MELO, R. C.; RIBEIRO, C.; MURRAY, C. S.; VELOSO, C. J. M.; SILVEIRA, C. H. da; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; CARCERONI, R. L.; SANTORO, M. M. We propose a novel method for defining patterns of contacts present in protein-protein complexes. A new use of the traditional contact maps (more frequently used for representation of the intra-chain... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2007
Frequência alélica de SNPS relacionados à termotolerância em raças bovinas criadas no Brasil. Autoria: SATE, M. L.; WALKER, C. C.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; EGITO, A. A. do Repositório: BDPA Ano de publicação: 2013
Identificação de proteínas de armazenamento em progenitores de trigo. Autoria: CAMPOS, L. A. C.; COSTA, M. S.; OTANI, L. T.; RIEDE, C. R.; MACHADO, J. C. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2011
Determinação de proteina por método não-convencional. Autoria: FERRI, N. M. L.; SILVEIRA, C. M. da; CORTELINI, M. de F. M. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
Protein cutoff scanning: a comparative analysis of cutoff dependent and cutoff free methods for prospecting contacts in proteins. Autoria: SILVEIRA, C. H. da; PIRES, D. E. V.; MINARDI, R.; RIBEIRO, C.; VELOSO, C. J. M.; LOPES, J. C. D.; MEIRA JÚNIOR, W.; NESHICH, G.; RAMOS, C. H. I.; HABESCH, R.; SANTORO, M. M. In this study, we carried out a comparative analysis between two classical methodologies to prospect residue contacts in proteins: the traditional cutoff dependent (CD) approach and cutoff free Delaun... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2009

Mostrando 1 - 10 de 957 resultados.

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