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Finding protein-protein interaction patterns by contact map matching. Autoria: MELO, R. C.; RIBEIRO, C.; MURRAY, C. S.; VELOSO, C. J. M.; SILVEIRA, C. H. da; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; CARCERONI, R. L.; SANTORO, M. M. We propose a novel method for defining patterns of contacts present in protein-protein complexes. A new use of the traditional contact maps (more frequently used for representation of the intra-chain... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2007
A simple and efficient method for predicting protein-protein interaction sites. Autoria: HIGA, R. H.; TOZZI, C. L. Computational methods for predicting protein-protein interaction sites based on structural data are characterized by an accuracy between 70 and 80%. Some experimental studies indicate that only a frac... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2008
A capsid protein fragment of a Fusagra-like virus found in Carica papaya latex interacts with the 50S Ribosomal protein L17. Autoria: MAURASTONI, M.; ANTUNES, T. F. S.; ABREU, E. F. M.; RIBEIRO, S. da G.; REIS, A. M. dos; SANCHES, M. M.; FONTES, W.; KITAJIMA, E. W.; CRUZ, F. T.; SANTOS, A. M. C.; VENTURA, J. A.; GOMES, A. C. M. M.; ZERBINI, F. M.; SOSA-ACOSTA, P.; NOGUEIRA, F. C. S.; RODRIGUES, S. P.; ARAGÃO, F. J. L.; WHITFIELD, A. E.; FERNANDES, P. M. B. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2023
Oligomerization affects the kinetics and thermodynamics of the interaction of a Bowman-Birk inhibitor with proteases. Autoria: BRAND, G. D.; PIRES, D. A. T.; FURTADO JUNIOR, J. R.; COOPER, A.; FREITAS, S. M.; BLOCH JUNIOR, C. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2017
Interaction between Bees and the Tristylous Flowers of Oxalis cytisoides Mart. & Zucc. (Oxalidaceae). Autoria: KRUG, C.; SILVA, C. I.; ALVES-DOS-SANTOS, I. The interaction of bees with the tristylous flowers of Oxalis cytisoides Mart. & Zucc. (Oxalidaceae) was evaluated. The study was conducted in a semideciduous forest at the Fritz Plaumann State Park i... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
Differential expression of candidate genes to resistance to Meloidogyne paranaensis in clones of Coffea canephora. Autoria: LIMA, E. A. de; REGO, E. C. S.; COTTA, M. G.; COSTA, T. S.; CARNEIRO, F. A.; CARNEIRO, R. M. D. G.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Phosphorus and silicon fertilizer rates effects on dynamics of soil phosphorus fractions in oxisol under common bean cultivation. Autoria: ALOVISI, A. M. T.; FURTINI NETO, A. E.; SERRA, A. P.; ALOVISI, A. A.; TOKURA, L. K.; LOURENTE, E. R. P.; SILVA, R. S. da; SILVA, C. F. B. da; FERNANDES, J. S. The purpose of this research was to evaluate the effects of P and Si fertilizer rates in dynamic of P fractions in clay soil under greenhouse. The research was carried out in a Dystroferric Red Latoso... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Improving predictions of protein-protein interfaces by combining amino acid-specific classifiers based on structural and physicochemical descriptors with their weighted neighbor averages. Autoria: MORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; PEREIRA, J. G. C.; SALIM, J. A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Protein-protein interactions are involved in nearly all regulatory processes in the cell and are considered one of the most important issues in molecular biology and pharmaceutical sciences but are st... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2014
2D maps of protein surface. Autoria: NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. Short Abstract: In this work, we present 2DIM (Two Dimensional Interface Maps). It is a graphical interface that permits to visualize the protein-protein interfaces in 2D maps. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Some Coffea liberica SH3-LRR-coding sequences are highly distinguishable. Autoria: ANGELO, P. C. da S.; PEREIRA, L. F. P.; SERA, G. H.; CAIXETA, E. T. Genes in coffee SH3 loci are involved in the interaction with the fungus Hemileia vastatrix. Previously we found, by comparison to data published for C. arabica ?IAPAR 59?, that SH3 loci are multi-ale... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2022

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