O objetivo deste projeto é construir e oferecer ao segmento produtivo da sociedade brasileira um "pipeline", ou seja, um processo de linha de montagem que gera um conhecimento agregado sobre as proteínas oriundas dos projetos genoma iniciados e/ou finalizados no Brasil. Este projeto visa fortalecer as colaborações existentes entre grupos de pesquisa estabelecidos e emergentes, estabelecer outras que auxiliem na obtenção dos resultados esperados e indiquem claramente os procedimentos e técnica

Situação: concluído     Data de Início: Sun Jun 01 00:00:00 GMT-03:00 2008

As enzimas têm sua função determinada essencialmente por alguns resíduos específicos, denominados de resíduos catalíticos. A maioria dos métodos para a predição dos resíduos catalíticos de enzimas utiliza ao menos um critério de conservação da sequência primária. Considerando que a função é decorrente da estrutura, este projeto almeja identificar dentre os descritores estruturais disponíveis na base de dados do sofware Sting aqueles de maior relevância para discriminar os resíduos catalíticos

Situação: concluído     Data de Início: Sun Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2010

Nas últimas duas décadas, a triagem virtual baseada na estrutura do receptor (SBVS, do inglês structure-based virtual screening) se tornou uma ferramenta útil no processo de planejamento racional de fármacos e agroquímicos. No entanto, apesar de diversos casos de sucesso, a SBVS ainda apresenta limitações, especialmente em relação ao ranqueamento de potenciais ligantes com base na afinidade de ligação. Nesta pesquisa, a partir da análise do nanoambiente de interação proteína-ligante, busca-se es ...

Situação: concluído     Data de Início: Sun Nov 01 00:00:00 GMT-03:00 2015

Interações proteína-proteína regulam virtualmente todos os processos dentro das células, como transdução de sinais, regulação metabólica, regulação gênica, respostas imunológicas que ocorrem de forma específica. Vários métodos experimentais são capazes de detectar interações entre proteínas que vão desde "resoluções" ao nível celular até experimentos que evidenciam as interações ao nível atômico, porém a performance de experimentos combinados que geram informações completas sobre a rede de in

Situação: concluído     Data de Início: Sat Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2009

As mudanças climáticas podem afetar a produtividade agrícola e devem impactar a produção de alimentos em um futuro próximo. A criação de cultivares tolerantes a estresses abióticos, como a seca, pode ser uma das maneiras de se adaptar as culturas agrícolas a esses efeitos. O processo de criação de cultivares passa pela descoberta de genes, um processo computacional de seleção de genes por meio de análises de bioinformática usando genomas, vias biológicas, dados de expressão gênica, dados da lite ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2019

As mudanças climáticas podem afetar a produtividade agrícola e devem impactar a produção de alimentos em um futuro próximo. A criação de cultivares tolerantes a estresses abióticos, como a seca por exemplo, pode ser uma das maneiras de se adaptar as culturas agrícolas a esses efeitos. O processo de criação de cultivares passa pela descoberta de genes, um processo computacional de seleção de genes por meio de análises de bioinformática usando genomas, vias biológicas, dados de expressão gênica, d ...

Situação: concluído     Data de Início: Sat Jul 01 00:00:00 GMT-03:00 2017

O objetivo deste projeto de pesquisa é atualizar a plataforma STING, com a modernização das ferramentas computacionais para análise e visualização de dados, dando suporte a novas tecnologias de software, além de renovar o maior banco de dados relacional mundial em termos dos descritores físico-químicos e estruturais das estruturas proteicas, o STING_RDB, contribuindo com novos conhecimentos sobre os nanoambientes internos das proteínas mais estudadas no mundo. A atualização da plataforma, que pr ...

Situação: concluído     Data de Início: Sun Dec 01 00:00:00 GMT-03:00 2019

Velloziaceae é uma família de angiospermas que contém as espécies mais tolerantes à dessecação (aproximadamente 200 de 270 espécies). Estas espécies estão distribuídas em cinco gêneros: Acantochilas, Xerophyta, Barbacenia, Barbaceniopsis e Vellozia. Mais de 80% das espécies de Velloziaceae ocorrem na América do Sul, onde a maior diversidade morfológica também é encontrada. O gênero Vellozia compreende ambas espécies tolerantes e não tolerantes à dessecação, oferecendo um excelente modelo para es ...

Situação: concluído     Data de Início: Thu Sep 01 00:00:00 GMT-03:00 2016